NGS & Genomik | 4-tägiges Praxistraining

Kursdetails

Überblick

Dieses intensive viertägige Praxistraining bietet eine strukturierte Einführung in Next-Generation Sequencing (NGS), genomische Arbeitsabläufe, Sequenziertechnologien und die Analyse von NGS-Daten.

Der Kurs umfasst den gesamten Arbeitsablauf: Versuchsplanung, Probenauswahl, Prinzipien der DNA-/RNA-Extraktion, Qualitätskontrolle von Nukleinsäuren, Bibliothekspräparation, Überblick über Sequenzierplattformen, Qualitätsbewertung der Rohdaten, Read-Alignment, Variantenbestimmung (Variant Calling), Genexpressionsanalyse, Datenvisualisierung und translationale Anwendungen der Genomik.

Die Teilnehmenden erwerben theoretisches Wissen und praktische Erfahrung mit den zentralen Labor- und Bioinformatikschritten der modernen Genomforschung. Der Workshop verbindet Vorträge, Demonstrationen, Laboreinheiten, computergestützte Analysen, Gruppenarbeit und wissenschaftliche Diskussion.

Am Ende des Kurses verstehen die Teilnehmenden, wie NGS-Projekte geplant, vorbereitet, analysiert und interpretiert werden – mit Schwerpunkt auf praxisnahen Arbeitsabläufen, Qualitätskontrolle und biologischer Aussagekraft.

Lernziele

Nach Abschluss des Workshops sind die Teilnehmenden in der Lage:

• die Grundprinzipien der Genomik und des Next-Generation Sequencing zu verstehen
• die wichtigsten Sequenziertechnologien, darunter Illumina, Nanopore und PacBio, zu vergleichen
• nachzuvollziehen, wie NGS-Projekte konzipiert und geplant werden
• geeignete Probentypen und Versuchsstrategien für NGS-Anwendungen auszuwählen
• Sicherheitsgrundsätze für BSL-2-Labore in molekularbiologischen Arbeitsabläufen anzuwenden
• die Prinzipien der DNA-/RNA-Extraktion und die Qualitätsanforderungen an Nukleinsäuren zu verstehen
• Nukleinsäuren zu quantifizieren und ihre Integrität zu bewerten bzw. diese Schritte zu verfolgen
• die Prinzipien der Bibliothekspräparation und Adapterligation zu verstehen
• DNA-Fragmentierung, PCR-Amplifikation, Aufreinigung und Bibliotheks-QC zu erklären
• den Aufbau von Sequenzierplattformen und die wichtigsten Aspekte eines Sequenzierlaufs zu verstehen
• mit grundlegenden NGS-Datenformaten wie FASTQ-Dateien zu arbeiten
• Qualitätskennzahlen und QC-Berichte von Sequenzierdaten zu interpretieren
• die Prinzipien von Read-Alignment, Genom-Mapping und Variant Calling zu verstehen
• einführendes Wissen zu RNA-seq und Genexpressionsanalysen zu erwerben
• NGS-Daten zu visualisieren und im biologischen Kontext zu interpretieren
• Anwendungen von NGS in Krebsgenomik, Präzisionsmedizin, RNA-seq, Einzelzelltechnologien und Multi-Omics-Forschung zu verstehen

Zielgruppe

Dieser Kurs eignet sich besonders für:

• Master-Studierende und Promovierende
• wissenschaftliche Hilfskräfte und technische Assistentinnen und Assistenten
• Studierende der Biomedizin, Biotechnologie, Molekularbiologie, Genetik und Life Sciences
• Forschende, die in die Genomik oder sequenzierbasierte Forschung einsteigen
• Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler, die NGS-Arbeitsabläufe von der Probenvorbereitung bis zur Datenauswertung verstehen möchten
• Fachkräfte aus Hochschule, Biotechnologie, Pharmaindustrie, Diagnostik oder translationaler Forschung
• Teilnehmende mit Interesse an Genomik, Präzisionsmedizin, Krebsforschung, RNA-seq, Einzelzelltechnologien oder Bioinformatik

Kursprogramm

Tag 1: Einführung in Next-Generation Sequencing & Versuchsplanung

Schwerpunkt: NGS-Grundlagen und Verständnis der Arbeitsabläufe

Tag 2: Bibliothekspräparation & Sequenzierablauf

Schwerpunkt: Vorbereitung der Proben für die Sequenzierung

Tag 3: Bioinformatik & NGS-Datenanalyse

Schwerpunkt: Von Rohdaten zu biologischen Erkenntnissen

Tag 4: Anwendungen der Genomik & translationales NGS

Schwerpunkt: Klinische und wissenschaftliche Anwendungen

Ihr Mehrwert

Die Teilnehmenden gewinnen:

• ein praxisnahes Verständnis von NGS- und Genomik-Arbeitsabläufen
• Wissen über die wichtigsten Sequenziertechnologien wie Illumina, Nanopore und PacBio
• Verständnis von Versuchsplanung und Probenauswahl für NGS-Projekte
• praktische Einblicke in DNA-/RNA-Extraktion und Qualitätskontrolle von Nukleinsäuren
• praktische Erfahrung mit Quantifizierung und Integritätsbewertung von Nukleinsäuren
• Verständnis von Bibliothekspräparation, Adapterligation, DNA-Fragmentierung, PCR-Amplifikation und Aufreinigung
• Wissen zu Bibliotheks-QC und Einrichtung von Sequenzierläufen
• einführende Erfahrung mit NGS-Datenformaten, FASTQ-Dateien und QC-Kennzahlen
• praxisnahes Verständnis von Read-Alignment, Genom-Mapping, Variant Calling und Grundlagen der Genexpressionsanalyse
• Kompetenz in Datenvisualisierung und biologischer Interpretation von Sequenzierergebnissen
• Einblick in NGS-Anwendungen in Krebsgenomik, RNA-seq, Einzelzellanalyse, Präzisionsmedizin und Multi-Omics
• Erfahrung aus einem Mini-Projekt zur Interpretation von NGS-Daten
• Vorbereitung auf künftige Arbeit in Genomik, Bioinformatik, Molekularbiologie, Biotechnologie und translationaler Forschung